Dlhodobá (doživotná) nákaza toxoplazmou, takzvaná latentná toxoplazmóza, nie je nebezpečná ani v tehotenstve. Nebezpečná je len čerstvá nákaza, ku ktorej došlo až behom tehotenstva alebo tesne pred jeho začiatkom. V takomto prípade hrozí, že sa nákaza prenesie na vyvíjajúci sa plod a spôsobí jeho vážne poškodenie. V prvom trimestri tehotenstva je pravdepodobnosť jej prenosu z čerstvo nakazenej matky na plod asi 15 %, následky však môžu byť veľmi vážne (potrat, narodenie dieťaťa so závažnou vývojovou vadou, vrátane hydrocefálie a mikrocefálie). Ak sa nakazí matka v treťom trimestri tehotenstva, je riziko prenosu nákazy na plod až 70 %, avšak následky toho bývajú menšie, typickým príkladom sú zápaly sietnice. Lekári sú schopní znížiť pravdepodobnosť prenosu nákazy na plod podávaním liekov proti akútnej toxoplazmóze (nie však podávaním bežných antibiotík).